من التحدّيات التي تواجه قطاع التعليم العالي في الأردن:

ضَعْف الموارد الماليّة المخصّصة للجامعات الخاصّة

الإقبال المتزايد على التعليم التقنيّ والمِهنيّ

ضَعْف ربط الأبحاث العلميّة بحاجات البلاد التنمويّة

ضَعْف الإقبال على برامج الدّراسات العُليا